Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fcho1Q8K285 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fcho1Q8K285 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fcho1Q8K285 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fcho1Q8K285 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fcho1Q8K285 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcho1Q8K285 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fcho1Q8K285 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Fcho1Q8K285 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcho1Q8K285 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms