Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh2d5Q8JZW5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh2d5Q8JZW5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms