Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Card11Q8CIS0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Card11Q8CIS0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms