Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrrc9Q8CDN9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrrc9Q8CDN9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms