Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Nhlrc3Q8CCH2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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