Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrn3Q8CBC6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrn3Q8CBC6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms