Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8C708 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q8C708 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q8C708 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q8C708 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q8C708 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Q8C708 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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