Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc22Q8C5N3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc22Q8C5N3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms