Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tnfsfm13Q8BXS2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tnfsfm13Q8BXS2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Tnfsfm13Q8BXS2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tnfsfm13Q8BXS2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tnfsfm13Q8BXS2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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