Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Grik4Q8BMF5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms