Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zcchc4Q8BKW4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms