Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tspan12Q8BKT6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms