Protein–RNA interactions for Protein: Q8BI41

Synb, Syncytin-B, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynbQ8BI41 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SynbQ8BI41 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SynbQ8BI41 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms