Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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