Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trmt12Q8BG71 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trmt12Q8BG71 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms