Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfascQ810U3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NfascQ810U3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms