Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChfrQ810L3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ChfrQ810L3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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