Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn34b3Q80ZS5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn34b3Q80ZS5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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