Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg2bQ80XK6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg2bQ80XK6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms