Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ttc28Q80XJ3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms