Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vgll4Q80V24 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vgll4Q80V24 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms