Protein–RNA interactions for Protein: Q80U58

Pum2, Pumilio homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum2Q80U58 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pum2Q80U58 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pum2Q80U58 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms