Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sgo2Q7TSY8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms