Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ClmQ7TSN2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms