Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf516Q7TSH3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Znf516Q7TSH3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms