Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrc2bQ7TPM1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrc2bQ7TPM1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms