Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Syne2Q6ZWQ0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Syne2Q6ZWQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms