Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Topbp1Q6ZQF0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Topbp1Q6ZQF0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms