Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80Q6ZPV2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80Q6ZPV2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80Q6ZPV2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms