Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf316Q6PGE4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf316Q6PGE4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms