Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rad54bQ6PFE3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rad54bQ6PFE3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms