Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gramd2bQ6PEM6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gramd2bQ6PEM6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms