Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc85bQ6PDY0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc85bQ6PDY0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms