Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atg2aQ6P4T0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg2aQ6P4T0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms