Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpsf6Q6NVF9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms