Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SphkapQ6NSW3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SphkapQ6NSW3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms