Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fbxo41Q6NS60 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo41Q6NS60 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms