Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcd11Q6NS46 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pdcd11Q6NS46 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pdcd11Q6NS46 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms