Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ParpbpQ6IRT3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms