Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Carmil1Q6EDY6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Carmil1Q6EDY6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms