Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smarca2Q6DIC0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smarca2Q6DIC0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms