Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q6DFW0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q6DFW0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms