Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx11Q6AXC6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms