Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cep290Q6A078 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Cep290Q6A078 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cep290Q6A078 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cep290Q6A078 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Cep290Q6A078 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cep290Q6A078 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Cep290Q6A078 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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