Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atg9aQ68FE2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atg9aQ68FE2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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