Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sbno1Q689Z5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sbno1Q689Z5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms