Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nlrp4eQ66X19 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nlrp4eQ66X19 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms