Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp9cQ66X01 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp9cQ66X01 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms