Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Surf4Q64310 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Surf4Q64310 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Surf4Q64310 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Surf4Q64310 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Surf4Q64310 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Surf4Q64310 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms