Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Polr2kQ63871 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms